5 мин чтения
Молекулярный докинг - это компьютерное моделирование, которое показывает, может ли молекула из эфирного масла «пристыковаться» к определённому белку в клетке и насколько прочно. Учёные dōTERRA и их партнёры используют докинг, чтобы понять, на что действуют компоненты масел, до того как проверять их на клетках и людях. Это ранний шаг исследования: он даёт гипотезу, а не доказательство.
Коротко
- Докинг - расчёт in silico, то есть в компьютере, без пробирок и людей.
- Программа подбирает, как молекула компонента масла ложится в «карман» белка, и оценивает прочность связи.
- Метод быстрый и недорогой, помогает выбрать, что проверять дальше в лаборатории.
- Хороший результат докинга не значит, что масло так действует в организме.
- dōTERRA сочетает докинг с протеомикой, анализом белков, и использует это и для поиска подделок.
Зачем вообще смотреть внутрь клетки
Люди давно замечают, что после масла кожа выглядит лучше или дышится свободнее. Но это внешние проявления. Чтобы понять, почему так происходит, нужно спуститься на уровень клеток и молекул: какой компонент масла с каким белком взаимодействует и что из этого следует.
Эфирное масло - смесь десятков, иногда сотен веществ. В лаванде это линалоол и линалилацетат, в копайбе бета-кариофиллен, в лимоне лимонен. Каждое вещество может взаимодействовать с разными мишенями. Проверить все пары «вещество плюс белок» в лаборатории долго и дорого. Тут и помогает компьютер.
Что такое in silico
В науке есть три главных уровня опытов:
- in vivo - на живом организме, животном или человеке;
- in vitro - в пробирке, на клетках или ферментах;
- in silico - в компьютере, через моделирование. Слово от кремния, из которого делают микросхемы.
Молекулярный докинг относится к третьей группе. Учёный берёт трёхмерную структуру белка, обычно из открытых баз, и структуру молекулы из масла. Программа перебирает тысячи положений и поворотов молекулы и ищет те, где она ложится в активный центр белка лучше всего. Каждому варианту присваивается оценка энергии связывания: чем она ниже, тем прочнее, по расчёту, будет контакт.
Как dōTERRA использует докинг
Журнал dōTERRA Living рассказывал, что учёные компании применяют докинг, протеомику и другие методы, чтобы изучать действие масел на молекулярном уровне. Протеомика - большое исследование белков: какие белки и в каком количестве появляются в клетке после воздействия.
Задачи, которые называет компания:
- понять, какие белки-мишени могут быть у компонентов масел;
- проверить, насколько эффективны привычные способы применения;
- точнее подбирать сочетания масел в смесях под конкретную задачу;
- находить новые возможные свойства компонентов;
- лучше распознавать синтетические добавки и подделки, которых становится больше с ростом рынка.
Последний пункт важен для покупателя. Подробнее о том, как ловят фальсификаты: сколько эфирных масел подделывают.
Пример из научной литературы
Чтобы понять, как выглядит такая работа, вот одна из ранних публикаций. В 2012 году индийские учёные в журнале Bioinformation смоделировали, как шесть компонентов эфирных масел связываются с ферментом эластазой. Они взяли цитраль, цитронеллаль, гераниаль, гераниол, тимол и линалоол и проверили их против эластазы из трёх источников: нейтрофилов человека, поджелудочной железы и бактерии синегнойной палочки.
Лучше всего по расчётам выглядел цитраль, основной компонент лемонграсса и лимонного мирта, с хорошей оценкой связывания и низкой прогнозируемой токсичностью. Авторы сделали вывод, что эти вещества стоит изучать дальше. Именно «изучать дальше»: без опытов на клетках и людях такой результат остаётся гипотезой.
Главное ограничение докинга
Компьютер видит идеальную картину: одна молекула, один белок, без организма вокруг. В жизни всё сложнее:
- вещество должно вообще попасть к белку: всосаться, не разрушиться, дойти до нужной ткани в нужной концентрации;
- в масле десятки компонентов, которые могут усиливать или ослаблять друг друга;
- модель белка неподвижна, а настоящий белок постоянно меняет форму;
- прочная связь в расчёте не гарантирует, что белок изменит свою работу.
Поэтому честная цепочка выглядит так: докинг подсказывает, что проверить; опыты на клетках показывают, есть ли эффект; исследования на людях отвечают, работает ли это в жизни и безопасно ли. Почему последний шаг так важен, разобрано в статье зачем нужны клинические исследования эфирных масел.
Как читать новости о докинге
Если вы видите заголовок «учёные выяснили, что компонент масла блокирует такой-то белок», проверьте, какого уровня это исследование. Если в тексте есть слова docking, in silico, computational, это расчёт. Интересно, но пока рано делать выводы для себя.
Больше ясности дают работы, где после расчёта были опыты на клетках, а лучше на людях. Такие исследования dōTERRA и других групп собраны на странице исследования, а научные разборы в разделе Наука. Как самому найти работу по нужному маслу, описано в статье как найти научную статью об эфирных маслах.
Зачем это покупателю
Докинг не скажет вам, какое масло взять вечером. Но он показывает, куда движется наука о маслах: от «помогает, потому что давно пользуются» к пониманию механизмов. Компании, которые вкладываются в такие исследования и публикуют результаты в рецензируемых журналах, дают больше оснований для доверия, чем красивые слова на этикетке.
Исследования
- Comparative molecular docking analysis of essential oil constituents as elastase inhibitors, Bioinformation, 2012 (английский язык) - компьютерная оценка связывания шести компонентов масел с эластазой.
Источники: журнал dōTERRA Living; журнал Bioinformation.
Хотите попробовать масла dōTERRA?
Масла заказываются по цене для участников, доставка со склада в России. Если сомневаетесь, почитайте чем они отличаются от аптечных и почему стоят дороже.
Зарегистрироваться и заказатьИнструкция со скриншотамиЗадать вопрос боту